Калькулятор концентрации белка

Рассчитайте концентрацию белка по оптической плотности A280 или калибровочной кривой Брэдфорда, BCA либо Лоури.

Количественный анализ белковой пробы
Выберите метод и введите оптическую плотность с поправкой на холостую пробу и соответствующие параметры калибровки.

Об измерении концентрации белка

Концентрацию белка обычно оценивают по поглощению ультрафиолета или колориметрическим методом в сравнении с известными стандартами. Измерение A280 использует поглощение ароматических аминокислот, прежде всего триптофана и тирозина. Если массовый коэффициент экстинкции задан в миллилитрах на миллиграмм на сантиметр, закон Бугера — Ламберта — Бера даёт концентрацию в миллиграммах на миллилитр: оптическую плотность с поправкой на холостую пробу делят на коэффициент и длину оптического пути. Затем результат умножают на коэффициент разведения. Методы Брэдфорда, бицинхониновой кислоты и Лоури создают окраску, оптическая плотность которой зависит от количества белка. Для них нужна калибровочная кривая, измеренная в тех же условиях, что и неизвестные пробы. Калькулятор использует линейное уравнение: оптическая плотность равна произведению наклона на концентрацию плюс свободный член. Для расчёта концентрации он вычитает свободный член, делит на наклон и учитывает разведение. Вводите параметры регрессии в единицах, дающих концентрацию в миллиграммах на миллилитр. Если стандарты приготовлены в других единицах, согласованно пересчитайте результат или калибровочные параметры. Надёжность количественного анализа зависит не только от арифметики, но и от качества эксперимента. Используйте для холостой пробы тот же буфер и реагенты, чистые совместимые кюветы или планшеты и работайте в проверенном диапазоне метода. Мутность, нуклеиновые кислоты, детергенты, восстановители, хелаторы, липиды и сильно поглощающие компоненты буфера могут искажать результат. Отклик в колориметрии также различается у разных белков. Стандарт, похожий на неизвестную пробу, обычно улучшает сопоставимость, а повторы стандартов и проб выявляют вариации дозирования и прибора. Длина оптического пути в микропланшете обычно не равна одному сантиметру, если ридер не выполняет коррекцию. Для A280 используйте эффективную или скорректированную длину пути прибора. Коэффициент экстинкции должен соответствовать белку, длине волны и принятому определению; молярный коэффициент нельзя напрямую вводить в поле массового. Оценивайте остатки регрессии и избегайте далёкой экстраполяции за калибровочную кривую. Концентрированные пробы лучше развести и измерить повторно, чем доверять значениям вне линейного диапазона. Инструмент выполняет указанный расчёт, но не проверяет подготовку проб, качество калибровки, совместимость анализа или работу прибора. Записывайте исходные показания, холостые пробы, стандарты, этапы разведения и единицы, чтобы обеспечить прослеживаемость результата.

Примеры расчёта концентрации белка

ИзмерениеКонцентрацияМетод
A = 0.8; коэффициент 1; путь 1 cm; разведение 21.6 mg/mLA280
A = 0.6; наклон 0.25; свободный член 0.1; разведение 24 mg/mLКривая Брэдфорда
A = 0.45; наклон 0.2; свободный член 0.05; разведение 12 mg/mLКривая BCA

Как рассчитать концентрацию белка

  1. Выберите A280 или колориметрический метод, использованный для пробы.
  2. Введите оптическую плотность с поправкой на холостую пробу и общий коэффициент разведения.
  3. Для A280 укажите подходящий массовый коэффициент экстинкции и длину оптического пути.
  4. Для Брэдфорда, BCA или Лоури укажите наклон и свободный член калибровочной прямой.
  5. Рассчитайте концентрацию и убедитесь, что показание находится в проверенном диапазоне.

Частые вопросы

Какой коэффициент разведения вводить?

Введите общую кратность разведения от исходной пробы до измеренного раствора. Для неразведённой пробы коэффициент равен единице.

Можно ли использовать молярный коэффициент экстинкции?

Не напрямую в этом поле для массового коэффициента. Пересчитайте его с учётом молекулярной массы и совместимых единиц или вычислите молярную концентрацию отдельно.

Почему нужно вычитать свободный член?

Свободный член описывает аппроксимированный отклик при нулевой концентрации и может учитывать фоновый сигнал. Поэтому при преобразовании уравнения его вычитают до деления на наклон.

Расчёты по Брэдфорду, BCA и Лоури одинаковы?

Химические реакции и мешающие факторы различаются, но линейную калибровочную зависимость преобразуют одинаково. Используйте данные именно для вашего метода, протокола, длины волны и условий планшета.

Что делать, если оптическая плотность вне диапазона стандартов?

Разведите пробу до проверенного диапазона и измерьте снова вместо экстраполяции. При повторном расчёте примените суммарный коэффициент разведения.