Calculadora de solubilidade de proteínas
Estime a concentração de proteínas em diferentes condições de pH, sal, temperatura e hidrofobicidade para orientar a otimização do tampão.
Sobre a solubilidade de proteínas
Exemplos de solubilidade de proteínas
Estes cenários de triagem mostram como as condições da solução alteram a estimativa empírica.
| Condições | Solubilidade estimada | Interpretação |
|---|---|---|
| 10 mg de BSA em 1 mL, pH 7.4, 0.15 M NaCl, 25°C, pI 4.7, índice 0.42 | 9.177 mg/mL | O pH está longe do pI, e a baixa concentração de sal é levemente favorável. |
| 5 mg de lisozima em 2 mL, pH 4.5, sem sal, 20°C, pI 11, índice 0.35 | 2.2375 mg/mL | O pH está longe do pI; a hidrofobicidade moderada gera um pequeno ajuste. |
| 2 mg de IgG em 0.5 mL, pH 7, 1 M NaCl, 4°C, pI 6.8, índice 0.55 | 0.42 mg/mL | A proximidade do pI, o sal elevado e a hidrofobicidade reduzem bastante a estimativa. |
| 8 mg de caseína em 1 mL, pH 4.6, 0.1 M NaCl, 37°C, pI 4.6, índice 0.6 | 1.764 mg/mL | O pH exatamente no pI e a alta hidrofobicidade preveem baixa solubilidade. |
Como estimar a solubilidade de proteínas
- Informe a massa de proteína e escolha miligramas ou gramas.
- Informe o volume de solvente, pH, temperatura, concentração de cloreto de sódio e ponto isoelétrico conhecido.
- Opcionalmente, informe um índice de hidrofobicidade de zero a um para uma estimativa mais conservadora.
- Selecione Calcular solubilidade e analise a concentração e as orientações de otimização.
- Compare várias condições e verifique experimentalmente o tampão mais promissor.
Dúvidas sobre solubilidade de proteínas
Por que a solubilidade costuma ser mínima perto do pI?
No ponto isoelétrico, a proteína tem pouca carga líquida e, portanto, menor repulsão eletrostática em relação às moléculas vizinhas. Interações atrativas podem predominar, aumentando agregação e precipitação.
Adicionar sal sempre melhora a solubilidade?
Não. Força iônica baixa ou moderada pode promover salting in, enquanto muito sal pode reduzir a água de hidratação disponível e causar salting out.
Como escolher o pH do tampão?
Comece na faixa efetiva do tampão e longe do pI quando a estabilidade da proteína permitir. Teste vários valores próximos, pois atividade e estabilidade estrutural podem impor limites adicionais.
O que representa o índice de hidrofobicidade?
É um indicador simplificado, de zero a um, do caráter apolar exposto ao solvente. Um valor maior sugere mais tendência à agregação, mas não substitui análises de sequência ou estrutura.
A estimativa serve para preparar uma formulação final?
Use-a na triagem inicial e na comparação, não como especificação de liberação. Confirme o resultado experimentalmente e teste atividade, agregação e estabilidade durante o período de armazenamento necessário.