タンパク質濃度計算機
A280吸光度、またはBradford、BCA、Lowry法の検量線からタンパク質濃度を計算します。
タンパク質試料の定量
測定法を選び、ブランク補正済み吸光度と対応する校正値を入力してください。
タンパク質濃度測定について
タンパク質濃度は一般に紫外吸光度、または既知の標準試料と比較する比色法で推定します。A280測定は芳香族アミノ酸、特にトリプトファンとチロシンの吸収を利用します。質量吸光係数がミリリットル毎ミリグラム毎センチメートルで得られる場合、ベール・ランベルトの法則により、ブランク補正済み吸光度を係数と光路長で割ると、ミリグラム毎ミリリットルの濃度が求まります。その結果に試料の希釈倍率を掛けます。
Bradford法、ビシンコニン酸法、Lowry法では発色し、その吸光度がタンパク質量に応じて変化します。未知試料と同じ条件で測定した検量線が必要です。この計算機は、吸光度=傾き×濃度+切片という一次式を使います。式を変形し、切片を引いて傾きで割り、希釈倍率を適用します。回帰で得た傾きと切片は、計算後の濃度がミリグラム毎ミリリットルになる単位で入力してください。標準試料の濃度単位が異なる場合は、結果または校正値を整合するよう換算してください。
信頼できる定量には計算だけでなく実験の質が重要です。同じ緩衝液と試薬でブランクを取り、清浄で適合するキュベットやプレートを使い、測定法の検証済み範囲内で測定してください。濁り、核酸、界面活性剤、還元剤、キレート剤、脂質、強く吸収する緩衝液成分は結果に偏りを生じさせます。比色法ではタンパク質ごとに応答も異なります。未知試料に近い標準物質を使うと比較しやすくなり、標準と試料を反復測定すると分注や装置のばらつきを把握できます。
マイクロプレートの光路長は、リーダーで補正しない限り通常一センチメートルではありません。A280には装置の実効光路長または補正光路長を使ってください。吸光係数はタンパク質、波長、係数の定義に合っている必要があり、質量吸光係数の欄にモル吸光係数を直接入力することはできません。残差を確認し、検量線から大きく外れた外挿を避けてください。高濃度試料は希釈して再測定し、直線範囲外の吸光度を信用しないでください。このツールは指定の計算のみを行い、試料調製、校正の質、測定法との適合性、装置性能は検証しません。濃度の追跡性を保つため、生の測定値、ブランク、標準試料、希釈手順、単位を記録してください。
タンパク質濃度の計算例
| 測定値 | 濃度 | 測定法 |
|---|---|---|
| A = 0.8;係数 1;光路長 1 cm;希釈倍率 2 | 1.6 mg/mL | A280 |
| A = 0.6;傾き 0.25;切片 0.1;希釈倍率 2 | 4 mg/mL | Bradford検量線 |
| A = 0.45;傾き 0.2;切片 0.05;希釈倍率 1 | 2 mg/mL | BCA検量線 |
タンパク質濃度の計算方法
- 試料に使用したA280または比色法を選びます。
- ブランク補正済みの試料吸光度と総希釈倍率を入力します。
- A280では、対応する質量吸光係数と光路長を入力します。
- Bradford、BCA、Lowry法では、検量線の傾きと切片を入力します。
- 濃度を計算し、測定値が検証済み範囲内にあることを確認します。
よくある質問
どの希釈倍率を入力すればよいですか?
元の試料から測定溶液までの総希釈倍率を入力してください。未希釈試料の希釈倍率は一です。
モル吸光係数は使えますか?
この質量吸光係数の欄には直接使えません。分子量と整合する単位で換算するか、モル濃度を別途計算してください。
検量線の切片を引くのはなぜですか?
切片は濃度ゼロでの当てはめ応答を表し、ベースライン信号を含む場合があります。そのため、回帰直線を変形して濃度を求める際は、傾きで割る前に切片を引きます。
Bradford、BCA、Lowry法の計算は同じですか?
化学反応や干渉特性は異なりますが、一次回帰した検量線の変形方法は同じです。実際の測定法、手順、波長、プレート条件に合った校正データを使ってください。
吸光度が標準範囲を外れたら?
外挿せず、検証済み範囲に入るよう試料を希釈して再測定してください。再計算時には全希釈工程を合わせた倍率を適用します。