Protein-Molekulargewichtsrechner

Das Molekulargewicht eines Proteins ist die Summe der mittleren Massen seiner Aminosäurereste zuzüglich der Masse eines Wassermoleküls für die Kettenenden. Dieser Rechner akzeptiert die Standard-Einbuchstabencodes der zwanzig üblichen Aminosäuren, entfernt Leerzeichen und Bindestriche und gibt die Schätzung in Dalton und Kilodalton aus. Ein Dalton entspricht ungefähr der Masse eines Wasserstoffatoms, ein Kilodalton entspricht tausend Dalton. Das Ergebnis hilft bei der Auswahl von Elektrophoresebedingungen, beim Prüfen einer erwarteten Western-Blot-Bande, bei der Reinigungsplanung oder beim Vergleich einer translatierten Sequenz mit einem bekannten Protein. Die Berechnung verwendet mittlere isotopische Restmassen statt monoisotopischer Massen. Für intakte Proteine und routinemäßige SDS-PAGE-Vergleiche ist die mittlere Masse meist zweckmäßig, da ein Makromolekül eine natürliche Isotopenmischung enthält. Die monoisotopische Masse verwendet dagegen das leichteste häufig vorkommende Isotop jedes Atoms und wird oft für kleine, in der Massenspektrometrie genau aufgelöste Peptide bevorzugt. Aufgrund dieser unterschiedlichen Konventionen kann der Rechnerwert von Software abweichen, die auf monoisotopische Masse eingestellt ist. Die Sequenz allein erfasst nicht jeden chemischen Beitrag einer realen Probe. Signalpeptidspaltung, Entfernung des initiierenden Methionins, Disulfidbildung, Glykosylierung, Phosphorylierung, Acetylierung, gebundene Cofaktoren, Affinitätstags und andere posttranslationale Modifikationen können die beobachtete Masse verändern. Die angezeigte Schätzung setzt ein unmodifiziertes, neutrales Polypeptid mit freien Amino- und Carboxylenden voraus. Jeder eingegebene Buchstabe zählt als ein eingebauter Rest; ein terminales Wassermolekül wird ergänzt, um die Zusammensetzung der vollständigen Kette wiederherzustellen. Nutze das Ergebnis als reproduzierbare theoretische Referenz, nicht als Garantie für Laufverhalten oder gemessene Masse. Die scheinbare Größe in der SDS-PAGE kann durch Proteinform, Ladung, Detergensbindung, Aggregation oder ungewöhnliche Aminosäurezusammensetzung abweichen. Vergleiche den berechneten Wert für die Versuchsplanung mit dem tatsächlich exprimierten Konstrukt einschließlich Tags und Linkern. Berücksichtige bekannte Prozessierungen oder kovalente Modifikationen separat.