蛋白質分子量計算器
依據單字母胺基酸序列估算蛋白質分子量,以道爾頓與千道爾頓表示。
計算蛋白質分子量
使用 20 種標準胺基酸的單字母代碼輸入蛋白質序列。
關於蛋白質分子量
蛋白質分子量是多肽鏈中各胺基酸殘基平均質量的總和,再加上末端對應的一個水分子質量。本計算器接受二十種常見胺基酸的標準單字母代碼,去除空格與連字號後,以道爾頓及千道爾頓顯示估算結果。一個道爾頓大致相當於一個氫原子的質量,一個千道爾頓等於一千道爾頓。結果可用於選擇電泳條件、核對西方墨點法中的預期條帶、規劃純化,或將轉譯得到的序列與已知蛋白質比較。
計算採用殘基的平均同位素質量,而非單同位素質量。由於巨分子含有天然同位素混合物,完整蛋白質及常規 SDS-PAGE 比較通常更適合使用平均質量。單同位素質量則使用每種原子最輕的常見同位素,通常用於質譜中能精確解析的小肽。兩種慣例不同,因此本計算器的值可能與設定為單同位素質量的軟體不完全一致。
僅憑序列無法涵蓋真實樣品中的所有化學貢獻。訊號肽切除、起始甲硫胺酸移除、雙硫鍵形成、醣基化、磷酸化、乙醯化、結合的輔因子、親和標籤及其他轉譯後修飾,都可能改變觀測質量。顯示的估算值假設蛋白質是未修飾、中性且具有游離胺基端與羧基端的多肽。每個輸入字母均視為一個已納入鏈中的殘基,再加入一個末端水分子,以還原完整鏈的組成。
請將結果作為可重現的理論參考,而非遷移位置或實測質量的保證。蛋白質形狀、電荷、界面活性劑結合、聚集或特殊胺基酸組成,都可能使 SDS-PAGE 的表觀分子量產生差異。規劃實驗時,請與實際表現的構築體比較,包括標籤及連接肽,並另行計入已知的加工過程或共價修飾。
蛋白質分子量範例
| 序列 | 殘基數 | 估算分子量 |
|---|---|---|
| A | 1 | 89.09 Da |
| AC | 2 | 192.23 Da |
| ACDE | 4 | 436.44 Da |
如何計算蛋白質分子量
- 複製以單字母胺基酸代碼表示的蛋白質序列。
- 將序列貼到蛋白質序列欄位,可保留空格與連字號。
- 選擇「計算分子量」,驗證序列並加總殘基質量。
- 查看以道爾頓及千道爾頓表示的估算質量,並確認殘基數。
常見問題
蛋白質分子量如何計算?
計算器將每個胺基酸殘基的平均分子質量相加,再為兩個末端加入一個水分子的質量,得到未修飾多肽鏈的理論質量。
為什麼實測蛋白質質量不同?
加工過程、轉譯後修飾、標籤、輔因子或同位素質量慣例都可能影響實驗質量。凝膠遷移也可能產生與真實分子質量不同的表觀分子量。
計算器支援三字母胺基酸代碼嗎?
不支援。輸入須使用 A、C、D、E 等標準單字母胺基酸代碼。空格與連字號會被忽略,因此可直接貼上帶格式的單字母序列。
Da 和 kDa 有何差別?
Da 表示道爾頓,是此處顯示的基本分子質量單位。kDa 表示千道爾頓,一個 kDa 等於一千 Da。
蛋白質標籤會自動計入嗎?
不會。估算僅包含序列中輸入的殘基。若需計算所表現融合構築體的質量,請加入完整的標籤與連接肽序列。