Calculateur de concentration en protéines

Calculez la concentration en protéines à partir de l'absorbance A280 ou d'une courbe étalon Bradford, BCA ou Lowry.

Quantifier un échantillon de protéines
Choisissez une méthode et saisissez l'absorbance corrigée du blanc avec les valeurs d'étalonnage adaptées.

À propos du dosage des protéines

La concentration en protéines est généralement estimée par absorbance ultraviolette ou par dosage colorimétrique comparé à des étalons connus. La mesure A280 exploite l'absorption des acides aminés aromatiques, notamment le tryptophane et la tyrosine. Avec un coefficient d'extinction massique en millilitres par milligramme par centimètre, la loi de Beer-Lambert donne la concentration en milligrammes par millilitre en divisant l'absorbance corrigée du blanc par le coefficient et le trajet optique. Le résultat est ensuite multiplié par le facteur de dilution. Les dosages de Bradford, à l'acide bicinchoninique et de Lowry produisent une coloration dont l'absorbance varie avec la quantité de protéines. Ils nécessitent une courbe étalon mesurée dans les mêmes conditions que les échantillons inconnus. Ce calculateur utilise une équation linéaire : absorbance égale pente multipliée par concentration plus ordonnée à l'origine. Il la réarrange en soustrayant l'ordonnée à l'origine, en divisant par la pente et en appliquant la dilution. Saisissez les paramètres de votre régression dans des unités donnant une concentration en milligrammes par millilitre. Si les étalons utilisent une autre unité, convertissez le résultat ou les valeurs d'étalonnage de façon cohérente. Une quantification fiable dépend de la qualité expérimentale, pas seulement du calcul. Faites le blanc avec le même tampon et les mêmes réactifs, utilisez des cuves ou plaques propres et compatibles et mesurez dans la plage validée du dosage. Turbidité, acides nucléiques, détergents, agents réducteurs, chélateurs, lipides et composants du tampon fortement absorbants peuvent biaiser les résultats. La réponse colorimétrique varie aussi selon la protéine. Un étalon proche de l'échantillon améliore généralement la comparabilité ; les répétitions des étalons et échantillons révèlent les variations de pipetage ou de l'instrument. Le trajet optique d'une microplaque n'est généralement pas d'un centimètre, sauf correction par le lecteur. Pour A280, utilisez le trajet effectif ou corrigé de l'appareil. Le coefficient d'extinction doit correspondre à la protéine, à la longueur d'onde et à la convention employée ; un coefficient molaire ne peut pas être saisi directement dans un champ massique. Examinez les résidus et évitez d'extrapoler loin de la courbe étalon. Diluez les échantillons concentrés et mesurez à nouveau plutôt que de vous fier à une absorbance hors de la plage linéaire. Cet outil effectue le calcul demandé, mais ne valide ni préparation, ni qualité d'étalonnage, ni compatibilité du dosage, ni performances instrumentales. Consignez les lectures brutes, blancs, étalons, étapes de dilution et unités pour assurer la traçabilité de la concentration.

Exemples de concentration en protéines

MesureConcentrationMéthode
A = 0.8 ; coefficient 1 ; trajet 1 cm ; dilution 21.6 mg/mLA280
A = 0.6 ; pente 0.25 ; ordonnée à l'origine 0.1 ; dilution 24 mg/mLCourbe de Bradford
A = 0.45 ; pente 0.2 ; ordonnée à l'origine 0.05 ; dilution 12 mg/mLCourbe BCA

Comment calculer la concentration en protéines

  1. Choisissez A280 ou le dosage colorimétrique utilisé pour l'échantillon.
  2. Saisissez l'absorbance corrigée du blanc et le facteur de dilution total.
  3. Pour A280, indiquez le coefficient d'extinction massique adapté et le trajet optique.
  4. Pour Bradford, BCA ou Lowry, indiquez la pente et l'ordonnée à l'origine de la courbe étalon.
  5. Calculez la concentration et vérifiez que la lecture se situe dans la plage validée.

Questions fréquentes

Quel facteur de dilution saisir ?

Saisissez le facteur total entre l'échantillon initial et la solution mesurée. Un échantillon non dilué a un facteur de dilution de un.

Puis-je utiliser un coefficient d'extinction molaire ?

Pas directement dans ce champ massique. Convertissez-le avec la masse moléculaire et des unités compatibles, ou calculez séparément la concentration molaire.

Pourquoi soustraire l'ordonnée à l'origine ?

Elle représente la réponse ajustée à concentration nulle et peut inclure le signal de fond. Le réarrangement de la droite impose donc de la soustraire avant de diviser par la pente.

Les calculs Bradford, BCA et Lowry sont-ils identiques ?

Leurs réactions et interférences diffèrent, mais une courbe étalon linéaire se réarrange de la même manière. Utilisez les données correspondant exactement au dosage, protocole, longueur d'onde et conditions de plaque.

Que faire si l'absorbance dépasse la plage étalon ?

Diluez l'échantillon pour revenir dans la plage validée et mesurez à nouveau plutôt que d'extrapoler. Appliquez le facteur de dilution cumulé au résultat recalculé.