Calculadora de peso molecular de proteínas

O peso molecular de uma proteína é a soma das massas médias dos resíduos de aminoácidos de uma cadeia polipeptídica, acrescida da massa de uma molécula de água correspondente às extremidades. Esta calculadora aceita os códigos padrão de uma letra dos vinte aminoácidos comuns, remove espaços e hífens e apresenta a estimativa em daltons e quilodaltons. Um dalton corresponde aproximadamente à massa de um átomo de hidrogênio, enquanto um quilodalton equivale a mil daltons. O resultado ajuda a escolher condições de eletroforese, conferir uma banda esperada em western blot, planejar a purificação ou comparar uma sequência traduzida com uma proteína conhecida. O cálculo usa massas isotópicas médias dos resíduos, e não massas monoisotópicas. A massa média costuma ser a escolha prática para proteínas intactas e comparações rotineiras de SDS-PAGE, pois uma macromolécula contém uma mistura natural de isótopos. Já a massa monoisotópica usa o isótopo comum mais leve de cada átomo e costuma ser preferida para pequenos peptídeos resolvidos com precisão em espectrometria de massas. Como essas convenções diferem, o valor desta calculadora pode não coincidir exatamente com o de um software configurado para massa monoisotópica. A sequência sozinha não descreve todas as contribuições químicas de uma amostra real. Clivagem do peptídeo sinal, remoção da metionina inicial, formação de pontes dissulfeto, glicosilação, fosforilação, acetilação, cofatores ligados, etiquetas de afinidade e outras modificações pós-traducionais podem alterar a massa observada. A estimativa considera um polipeptídeo neutro, não modificado, com extremidades amino e carboxila livres. Cada letra inserida representa um resíduo incorporado, e uma molécula de água terminal é adicionada para restaurar a composição da cadeia completa. Use o resultado como referência teórica reproduzível, não como garantia de migração ou massa medida. O tamanho aparente em SDS-PAGE pode variar devido à forma da proteína, à carga, à ligação ao detergente, à agregação ou a uma composição incomum de aminoácidos. Ao planejar experimentos, compare o valor calculado com o construto realmente expresso, incluindo etiquetas e linkers, e considere separadamente qualquer processamento ou modificação covalente conhecidos.