Calculateur de l'indice de diversité de Simpson

Calculez l'indice de Simpson, l'indice de diversité et l'indice réciproque à partir des effectifs par espèce.

Mesurer la biodiversité
Saisissez pour chaque espèce un effectif entier positif ou nul.

À propos de l'indice de diversité de Simpson

L'indice de diversité de Simpson résume la biodiversité en combinant richesse spécifique et équitabilité. La richesse est le nombre d'espèces représentées ; l'équitabilité décrit la régularité de la répartition des individus entre elles. Une communauté riche en espèces peut rester dominée par une seule, si bien que le simple décompte des catégories ne suffit pas à décrire sa structure. La méthode de Simpson utilise chaque effectif pour quantifier la probabilité que deux individus choisis au hasard appartiennent à la même espèce. L'indice original de Simpson, D, est la somme, pour chaque espèce, de n multiplié par n moins un, divisée par N multiplié par N moins un. n désigne l'effectif d'une espèce et N l'effectif total. Cette forme pour population finie représente la probabilité que deux individus tirés sans remise appartiennent à la même espèce. La valeur approche un lorsqu'une espèce domine fortement la communauté et diminue lorsque l'abondance se répartit plus équitablement entre davantage d'espèces. Comme une forte diversité correspond à un D faible, les rapports présentent souvent l'indice de diversité, un moins D. Cette transformation donne une échelle intuitive où les valeurs proches de un indiquent davantage de diversité. La forme réciproque, un divisé par D, est également courante. Elle peut s'interpréter comme une mesure de diversité effective, sans être assimilée au nombre réel d'espèces. Nommez toujours la version présentée, car les publications emploient parfois l'expression indice de Simpson pour des transformations différentes. Le calculateur attend les effectifs bruts entiers positifs ou nuls de chaque espèce, séparés par des virgules, espaces ou points-virgules. Les zéros sont acceptés lorsqu'une catégorie prévue dans le plan d'échantillonnage n'a pas été observée ; omettre ces catégories ne change pas le calcul. Il faut au moins deux organismes au total, car la formule concerne des paires tirées sans remise. Le calculateur fournit les trois formes courantes pour comparer manuels et études sans conversion manuelle. Le plan d'échantillonnage compte autant que le calcul. Des échantillons issus de zones, saisons, efforts ou méthodes de collecte différents ne sont pas forcément comparables. Les petites tailles d'échantillon peuvent faire manquer les espèces rares, et les regroupements taxonomiques influencent richesse et équitabilité. L'indice de Simpson accorde plus de poids aux espèces communes que beaucoup d'autres mesures : il est relativement stable, mais moins sensible aux catégories rares. Utilisez des protocoles cohérents, précisez la taille de l'échantillon et la convention retenue, et envisagez l'entropie de Shannon ou la richesse pour une interprétation écologique plus large. Ce calculateur fournit des estimations ponctuelles reproductibles pour l'écologie, la conservation, les microbiomes, les parts de marché et la concentration de catégories.

Exemples de l'indice de diversité de Simpson

Comparez des communautés aux répartitions d'abondance différentes.

Effectifs par espèceIndicesInterprétation
5, 8, 12, 5, 3D = 0.221591; 1 - D = 0.778409Cinq espèces représentées forment une communauté modérément diversifiée.
10, 10, 10D = 0.310345; 1 / D = 3.222222Des effectifs égaux maximisent l'équitabilité de ces trois espèces.
28, 1, 1D = 0.868966; 1 - D = 0.131034Une espèce dominante entraîne une faible diversité malgré trois espèces présentes.

Comment calculer la diversité de Simpson

  1. Comptez les individus de chaque espèce dans un même échantillon cohérent.
  2. Saisissez les effectifs par espèce, séparés par des virgules, espaces ou points-virgules.
  3. Sélectionnez Calculer la diversité pour obtenir D, un moins D et l'indice réciproque.
  4. Précisez la convention utilisée lors de toute comparaison ou présentation des résultats.

Questions fréquentes sur l'indice de Simpson

Que signifie l'indice de Simpson D ?

D estime la probabilité que deux individus choisis au hasard soient de la même espèce. Un D plus élevé indique une dominance accrue, donc une diversité plus faible.

Une valeur de Simpson plus élevée est-elle préférable ?

Cela dépend de la forme présentée. Un moins D ou un divisé par D plus élevé indique davantage de diversité, tandis qu'un D original plus élevé indique moins de diversité.

Pourquoi le calculateur affiche-t-il trois indices ?

Les domaines et sources utilisent diverses transformations de Simpson sous des noms similaires. Afficher les trois évite l'ambiguïté et facilite les comparaisons.

Puis-je inclure une espèce d'effectif nul ?

Oui, zéro est accepté et ne modifie pas les sommes. Il peut être utile pour conserver une liste d'espèces prédéfinie entre échantillons.

Quelle différence avec l'entropie de Shannon ?

L'indice de Simpson donne relativement plus d'influence aux espèces communes et à la dominance. L'entropie de Shannon est généralement plus sensible à la richesse et aux espèces moins communes.