蛋白质分子量计算器

根据单字母氨基酸序列估算蛋白质分子量,以道尔顿和千道尔顿表示。

计算蛋白质分子量
使用 20 种标准氨基酸的单字母代码输入蛋白质序列。

关于蛋白质分子量

蛋白质分子量是多肽链中各氨基酸残基平均质量之和,再加上末端对应的一个水分子的质量。本计算器接受二十种常见氨基酸的标准单字母代码,去除空格和连字符后,以道尔顿和千道尔顿显示估算结果。一个道尔顿大致相当于一个氢原子的质量,一个千道尔顿等于一千道尔顿。结果可用于选择电泳条件、核对蛋白质印迹中的预期条带、规划纯化,或将翻译得到的序列与已知蛋白质进行比较。 计算采用残基的平均同位素质量,而非单同位素质量。由于大分子含有天然同位素混合物,完整蛋白质及常规 SDS-PAGE 比较通常更适合采用平均质量。单同位素质量则使用每种原子最轻的常见同位素,通常用于质谱中能够精确分辨的小肽。两种约定不同,因此本计算器的值可能与设置为单同位素质量的软件不完全一致。 仅凭序列无法涵盖真实样品中的所有化学贡献。信号肽切除、起始甲硫氨酸去除、二硫键形成、糖基化、磷酸化、乙酰化、结合的辅因子、亲和标签及其他翻译后修饰都可能改变观测质量。显示的估算值假设蛋白质是未修饰、中性且具有游离氨基端和羧基端的多肽。每个输入字母均视为一个已并入链中的残基,再加上一个末端水分子,以还原完整链的组成。 请将结果用作可重复的理论参考,而非迁移位置或实测质量的保证。蛋白质形状、电荷、去污剂结合、聚集或特殊氨基酸组成,都可能使 SDS-PAGE 的表观分子量产生差异。规划实验时,请与实际表达的构建体比较,包括标签和连接肽,并单独计入已知的加工过程或共价修饰。

蛋白质分子量示例

序列残基数估算分子量
A189.09 Da
AC2192.23 Da
ACDE4436.44 Da

如何计算蛋白质分子量

  1. 复制以单字母氨基酸代码表示的蛋白质序列。
  2. 将序列粘贴到蛋白质序列字段中,可以保留空格和连字符。
  3. 选择“计算分子量”,校验序列并汇总残基质量。
  4. 查看以道尔顿和千道尔顿表示的估算质量,并确认残基数。

常见问题

蛋白质分子量如何计算?

计算器将每个氨基酸残基的平均分子质量相加,再为两个末端加上一个水分子的质量,得到未修饰多肽链的理论质量。

为什么实测蛋白质质量不同?

加工过程、翻译后修饰、标签、辅因子或同位素质量约定都可能影响实验质量。凝胶迁移也可能产生与真实分子质量不同的表观分子量。

计算器支持三字母氨基酸代码吗?

不支持。输入应使用 A、C、D、E 等标准单字母氨基酸代码。空格和连字符会被忽略,因此可直接粘贴带格式的单字母序列。

Da 和 kDa 有什么区别?

Da 表示道尔顿,是此处显示的基本分子质量单位。kDa 表示千道尔顿,一个 kDa 等于一千 Da。

蛋白质标签会自动计入吗?

不会。估算只包括序列中输入的残基。如需计算所表达融合构建体的质量,请加入完整的标签和连接肽序列。