等电点计算器
根据氨基酸序列计算肽或蛋白质的等电点,并估算任意 pH 下的净电荷。
计算 pI 与净电荷
使用氨基酸单字母代码,并选择 0 至 14 之间的目标 pH。
关于等电点计算
等电点通常缩写为 pI,是分子的平均净电荷为零时的 pH。对于肽和蛋白质,该值主要取决于可电离的氨基末端、羧基末端及侧链。分子处于等电点时仍可含有带正电和负电的基团,但平均电荷相互抵消。本计算器直接根据氨基酸单字母序列估算这种平衡。
电荷随 pH 连续变化。在低 pH 下,质子化有利于形成带正电的氨基,并抑制带负电的羧酸根。在高 pH 下,去质子化减少正电荷并增加负电荷。亨德森–哈塞尔巴尔赫关系式将各基团的 pKa 与所选 pH 换算为分数电荷。将这些贡献相加即可估算净电荷,而不是将每个残基强制视为完全带电或完全不带电。
本实现采用一组常用的教学 pKa 值:氨基末端 9.69、羧基末端 2.34、天冬氨酸 3.86、谷氨酸 4.25、组氨酸 6.00、半胱氨酸 8.33、酪氨酸 10.07、赖氨酸 10.50、精氨酸 12.40。通过在 pH 0 至 14 范围内进行二分搜索,找出计算净电荷经过零的位置。显示结果四舍五入至两位小数。
实验 pI 值可能不同,因为残基的局部环境会改变其 pKa。邻近电荷、溶剂暴露、氢键、蛋白质折叠、二硫键形成、末端修饰、磷酸化及其他翻译后修饰都会产生影响。不同文献的 pKa 表也会给出略有差异的预测。因此,基于序列的 pI 适合用于规划与比较,但不能精确替代等电聚焦或其他实验测量。
等电点会影响蛋白质溶解度、电泳迁移、纯化、结晶及制剂设计。蛋白质在等电点附近通常溶解度较低,因为静电排斥最弱。离子交换色谱常根据 pI 选择缓冲液 pH:低于 pI 时,蛋白质通常净带正电;高于 pI 时,通常净带负电。指定 pH 下的计算电荷可帮助初步选择离子交换介质和缓冲液条件。
请仅输入标准氨基酸字母,工具会自动规范空格与大小写。模型不处理含义不明确的代码和化学修饰。为便于比较,应使用相同 pKa 约定下的预测,并通过实验验证重要的实验室决策。
等电点示例
| 序列 | 近似 pI | 说明 |
|---|---|---|
| K | 10.10 | 赖氨酸侧链使这个短肽呈较强碱性。 |
| D | 3.10 | 天冬氨酸侧链使这个短肽呈酸性。 |
| GGGG | 6.02 | 没有可电离侧链时,电荷平衡由末端基团决定。 |
如何计算蛋白质 pI
- 使用标准氨基酸单字母代码粘贴肽或蛋白质序列。
- 输入还需估算该序列净电荷的 pH。
- 选择“计算 pI 与电荷”,评估所有可电离基团。
- 将预测 pI 和电荷作为规划估算值,并通过实验考虑修饰的影响。
等电点常见问题
蛋白质的 pI 是什么意思?
pI 是蛋白质平均净电荷为零时的 pH。即使总电荷相互抵消,带正电和负电的基团仍可存在。
为什么预测 pI 与测量值可能不同?
序列计算使用固定的参考 pKa 值。折叠、溶剂暴露、邻近残基及化学修饰会改变实际 pKa。
蛋白质在低于 pI 时带正电吗?
典型蛋白质在低于 pI 时平均净带正电。在高于 pI 时,去质子化通常使其平均净带负电。
哪些残基会影响蛋白质电荷?
在本模型中,天冬氨酸、谷氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、组氨酸、赖氨酸和精氨酸具有可电离侧链。氨基末端和羧基末端也会贡献电荷。
计算器可以模拟修饰后的蛋白质吗?
不能。本工具仅评估标准氨基酸序列与游离末端。磷酸化、酰胺化或末端封闭等修饰需要专门模型。