等电点计算器

根据氨基酸序列计算肽或蛋白质的等电点,并估算任意 pH 下的净电荷。

计算 pI 与净电荷
使用氨基酸单字母代码,并选择 0 至 14 之间的目标 pH。

关于等电点计算

等电点通常缩写为 pI,是分子的平均净电荷为零时的 pH。对于肽和蛋白质,该值主要取决于可电离的氨基末端、羧基末端及侧链。分子处于等电点时仍可含有带正电和负电的基团,但平均电荷相互抵消。本计算器直接根据氨基酸单字母序列估算这种平衡。 电荷随 pH 连续变化。在低 pH 下,质子化有利于形成带正电的氨基,并抑制带负电的羧酸根。在高 pH 下,去质子化减少正电荷并增加负电荷。亨德森–哈塞尔巴尔赫关系式将各基团的 pKa 与所选 pH 换算为分数电荷。将这些贡献相加即可估算净电荷,而不是将每个残基强制视为完全带电或完全不带电。 本实现采用一组常用的教学 pKa 值:氨基末端 9.69、羧基末端 2.34、天冬氨酸 3.86、谷氨酸 4.25、组氨酸 6.00、半胱氨酸 8.33、酪氨酸 10.07、赖氨酸 10.50、精氨酸 12.40。通过在 pH 0 至 14 范围内进行二分搜索,找出计算净电荷经过零的位置。显示结果四舍五入至两位小数。 实验 pI 值可能不同,因为残基的局部环境会改变其 pKa。邻近电荷、溶剂暴露、氢键、蛋白质折叠、二硫键形成、末端修饰、磷酸化及其他翻译后修饰都会产生影响。不同文献的 pKa 表也会给出略有差异的预测。因此,基于序列的 pI 适合用于规划与比较,但不能精确替代等电聚焦或其他实验测量。 等电点会影响蛋白质溶解度、电泳迁移、纯化、结晶及制剂设计。蛋白质在等电点附近通常溶解度较低,因为静电排斥最弱。离子交换色谱常根据 pI 选择缓冲液 pH:低于 pI 时,蛋白质通常净带正电;高于 pI 时,通常净带负电。指定 pH 下的计算电荷可帮助初步选择离子交换介质和缓冲液条件。 请仅输入标准氨基酸字母,工具会自动规范空格与大小写。模型不处理含义不明确的代码和化学修饰。为便于比较,应使用相同 pKa 约定下的预测,并通过实验验证重要的实验室决策。

等电点示例

序列近似 pI说明
K10.10赖氨酸侧链使这个短肽呈较强碱性。
D3.10天冬氨酸侧链使这个短肽呈酸性。
GGGG6.02没有可电离侧链时,电荷平衡由末端基团决定。

如何计算蛋白质 pI

  1. 使用标准氨基酸单字母代码粘贴肽或蛋白质序列。
  2. 输入还需估算该序列净电荷的 pH。
  3. 选择“计算 pI 与电荷”,评估所有可电离基团。
  4. 将预测 pI 和电荷作为规划估算值,并通过实验考虑修饰的影响。

等电点常见问题

蛋白质的 pI 是什么意思?

pI 是蛋白质平均净电荷为零时的 pH。即使总电荷相互抵消,带正电和负电的基团仍可存在。

为什么预测 pI 与测量值可能不同?

序列计算使用固定的参考 pKa 值。折叠、溶剂暴露、邻近残基及化学修饰会改变实际 pKa。

蛋白质在低于 pI 时带正电吗?

典型蛋白质在低于 pI 时平均净带正电。在高于 pI 时,去质子化通常使其平均净带负电。

哪些残基会影响蛋白质电荷?

在本模型中,天冬氨酸、谷氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、组氨酸、赖氨酸和精氨酸具有可电离侧链。氨基末端和羧基末端也会贡献电荷。

计算器可以模拟修饰后的蛋白质吗?

不能。本工具仅评估标准氨基酸序列与游离末端。磷酸化、酰胺化或末端封闭等修饰需要专门模型。